中学学生会以主席团为领导核心，包括学生会主席一人，副主席若干人。在主席团以下设数个职能部门，一般包括办公室（主席团与秘书部）、班联部（班级成员联合部）、宣传部、组织部、学习部、实践部、体育部、文艺部、生活部、纪律部（纪委、纪检部）、楼管部（男生内务部与女生管理部）、外联部（外宣部）、社团部、技术部等。
各部门设部长一名、副部长2名，部门秘书1名，干事若干名